物理治療師會因應患者的情況， 調較衝擊波的聚焦深淺度及強度; 治療師亦會因應患處的數量、患處的大小決定治療時間。衝擊波治療過程中， 患處會感到一定程度的酸軟、疼痛或反射式疼痛， 當聚焦於非患處時患者通常不會感到不適。每次治療時按病程每個部位會被衝擊波撞擊2000至4000次。每星期接受一至三次治療， 經六至八次衝擊波治療後，應有顯著的治療效果。完成衝擊波治療後， 病人可能於一至兩天內感到患處疼痛、肌肉拉緊或腫脹， 少部份患者在治療後皮膚表層有機會出現輕微血瘀或紅腫等徵狀， 約兩天內便會消退，不會對身體組織造成傷害。